Всей тонкости этого вопроса я, конечно, сказать не могу (просто в юридические тонкости не вдавалась), но у меня все по договору. Отчисления в налоговую и пенсионный согласно зарплате и тарифу. Каждый год отчеты (в них же вы будете «показывать» зарплату, отсюда и объём налога). А вот на счет квитанций, я ведь не предоставляю никаких платных услуг от своего имени (я выполняю работу по договору), соответственно и квитанций я на себя не выписываю. Квитанции выписываю только от имени и на имя врача. Договор, если я ничего не путаю, заключается на год.
Добавлено спустя 7 минут 24 секунды:
Когда оформляли лицензию, требовали именно трудовой договор, до этого было трудовое соглашение (видимо на юридическом языке это разные вещи

) Образец качала из инета, что-то дорабатывала сама, в соответствии с нашей спецификой.